Относительно небольшая территория заповедника "Кивач" служит своего рода «островком безопасности» для многих видов растений.
Общее число выявленных видов - 2256, из них: грибы - 847, мхи - 251, лишайники - 314, сосудистые растения - 844.
13 видов включены в Красную книгу Российской Федерации, 89 видов включены в Красную книгу Республики Карелия